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09/03/2015 - Nota de prensa

Investigadores del IMIM i de la UPF publican el trabajo más exhaustivo sobre terapias dirigidas a alteraciones genómicas del cáncer hecho hasta ahora

El trabajo ha sido llevado a cabo por miembros del Programa de Investigación en Informática Biomédica (GRIB) de la UPF y el IMIM y se ha publicado en la revista Cancer Cell

Nota de prensa generada por la UPF

Durante los últimos años, las terapias contra el cáncer han evolucionado para adaptarse mejor a las características específicas de la enfermedad de cada paciente, lo que se traduce en tratamientos más eficientes en erradicar las células malignas y menos efectos secundarios para los tejidos sanos. Estas terapias, que se denominan dirigidas porqué atacan selectivamente los mecanismos patológicos propios de la célula cancerígena, ya se utilizan actualmente en la práctica clínica: por ejemplo, el uso de inhibidores de ciertos receptores hormonales que se encuentran sobre expresados en determinados pacientes de cáncer de mama, o de inhibidores de ciertas proteínas quinasas que están sobre activadas en determinados tipos de leucemia.

A pesar de estos, y otros, ejemplos, todavía no existen terapias dirigidas para el tratamiento de la gran mayoría de los pacientes, debido principalmente al desconocimiento de los mecanismos básicos que sustentan y promueven la enfermedad en estos casos. Sin embargo, este escenario puede cambiar gracias a los recientes avances en la secuenciación de los genomas de los tumores, que han revolucionado la capacidad para observar y entender los cambios que pasan en las células cancerígenas a nivel molecular.

Un estudio publicado en la revista Cancer Cell, co-supervisado por Nuria López Bigas, investigadora ICREA del Departamento de Ciencias Experimentales y de la Salud (CEXS) y coordinadora del Laboratorio de Genómica Biomédica del Programa de Investigación en Informática Biomédica (GRIB) de la UPF y el IMIM y Abel González-Pérez, investigador Ramón y Cajal del mismo programa, ha analizado los datos de secuenciación de tumores que han sido generadas durante los últimos años - en su mayoría a través de los estudios de los consorcios internacionales de TCGA (The Cancer Genome Atlas) y ICGC (International Cancer Genome Consortium) - para evaluar cuál es la aplicabilidad teórica de las terapias dirigidas que ya se encuentran disponibles y las que están en fase de desarrollo para el tratamiento de 28 tipos de los cánceres más prevalentes en la población humana.

Para hacerlo, primero se han estudiado las alteraciones observadas en el genoma de 6.792 tumores con diferentes métodos computacionales destinados a predecir cuáles de éstas son las responsables de la transformación maligna de las células de cada uno de ellos. Segundo, se han identificado in silico aquellos agentes terapéuticos capaces de inhibir de forma directa o indirecta el efecto de estas alteraciones, teniendo en cuenta fármacos ya aprobados para la práctica clínica, pero también aquellos que actualmente están en estudios clínicos o preclínicos.

Como resultado, aunque sólo en un 6% de los pacientes se puede prescribir una de las terapias dirigidas que actualmente ya están aprobadas en las guías clínicas, el estudio identifica hasta un 40% de los tumores en los que potencialmente podría utilizarse uno de estos fármacos que ya se encuentran aprobados para otra indicación.

"El estudio permite cuantificar hasta qué punto fármacos que ya se han demostrado eficaces clínicamente por perfiles concretos de pacientes podrían ser útiles para nuevos casos", dice Carlota Rubio-Pérez, primer autor del trabajo: "Los fármacos ya aprobados tienen la ventaja que se conoce con más detalle sus mecanismos de acción, así como su perfil de administración y de seguridad para los enfermos, siendo candidatos ideales para estudiar su uso para nuevas indicaciones ".

Además, el porcentaje de casos que podrían beneficiarse de las terapias dirigidas aumenta hasta el 73% cuando se consideran fármacos que actualmente se encuentran en fases de investigación clínica. El estudio ha identificado también un total de 80 genes que promueven diferentes mecanismos de la tumorigénesis y que no tienen ningún fármaco disponible pero que podrían ser "inhibibles" molecularmente, lo que los hace buenos candidatos para el desarrollo de nuevos agentes terapéuticos.

"Este estudio es el más detallado realizado de este tipo hasta el momento, debido a, por un lado, la cantidad de datos genómicos analizados y, por otro, por la recopilación del mecanismo de acción de fármacos en diferentes fases de aprobación que se ha hecho", ha manifestado Nuria López-Bigas, co-supervisora del estudio. "Como resultado, se han generado una serie de recursos sobre las alteraciones genómicas responsables de la tumorigénesis y las interacciones de estos productos con agentes terapéuticos disponibles que son de gran interés para la comunidad científica".

"Es importante destacar que este trabajo presenta el margen teórico de la aplicabilidad de estas terapias, es decir, el número de pacientes que podrían potencialmente beneficiarse de estas opciones. Su uso según prescripciones basadas en evidencias clínicas hoy en día todavía se limita a un porcentaje reducido de los pacientes " ha manifestado David Tamborero, coautor del estudio.

"Sin embargo, hemos observado que el uso de estos fármacos ya aprobados podría extenderse a nuevos casos, y además, un porcentaje importante de los pacientes también podría beneficiarse de fármacos que actualmente están en estudios clínicos o en fases previas. Aunque todavía se necesita mucha más investigación para demostrar la eficacia de cada una de estas observaciones en la práctica clínica, este estudio da una idea de cuál es el potencial de cada una de las soluciones disponibles en la actualidad y ofrece los recursos para explorarlo de manera eficiente ", ha añadido Tamborero.

Trabajo de referencia:

Carlota Rubio-Pérez, David Tamborero, Michael P. Schroeder, Albert A. Antolín, Jordi Diez-Pons, Christian Perez-Llamas, Jordi Mestres, Abel González-Pérez, Nuria López-Bigas (2015), "In Silico Prescription of anticáncer Drugs to Cohortes of 28 Tumor Types Reveal Targeting Opportunities ", Cancer Cell 27, 1-15 March 9, http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2015.02.007.

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