IMIM - Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques

Notícies

Nota de premsa

El "Lego" semàntic: una infraestructura d'informació per guiar el descobriment de fàrmacs.

Participen en el projecte investigadors del Programa de Recerca en Informàtica Biomèdica de l'IMIM-UPF

Un nou consorci d'organitzacions europees s'uneix per donar suport a la pròxima generació de tecnologies de descobriment de fàrmacs, proporcionant un accés unificat a múltiples fonts de dades que permetrà enllaçar la web semàntica amb la investigació farmacèutica.

El consorci Open PHACTS, finançat per la Iniciativa Europea a Medicaments Innovadors (IMI) facilitarà el descobriment de nous fàrmacs mitjançant l'aplicació de tecnologies semàntiques en els recursos d'informació disponibles i la creació d'un Espai Farmacològic Obert.

Actualment, les empreses farmacèutiques dediquen esforços significatius i redundants a l'harmonització i integració de la informació interna amb les fonts d'informació pública. En bona part, aquest procés és incompatible amb l'aplicació de mètodes computacionals massius i la gran majoria de les fonts d'informació usades en descobriment de fàrmacs no poden comunicar-se fàcilment entre si.

Open PHACTS (Open Pharmacological Concepts Triple Store) proporcionarà un accés gratuït i unificat a múltiples fonts de dades. En el cas dels textos científics, difícils d'analitzar computacionalment, s'extrauran les assercions en forma de "triplets semàntics" normalitzats, el que permetrà per primera vegada interrogar conjuntament fonts textuals i bases de dades amb la finalitat d'obtenir la informació necessària per a la identificació de noves dianes terapèutiques i interaccions farmacològiques. Fins ara, els mètodes semàntics s'havien aplicat només a petita escala i en aplicacions concretes, deixant en gran part incomplerta la seva promesa de proporcionar integració de dades en múltiples nivells. Open PHACTS és un gran projecte en el qual participen molts dels millors experts en webs semàntiques compromesos a complir aquesta promesa.

L'èxit del projecte Open PHACTS pot portar a que progressivament investigadors de tot el món capturin i distribueixin dades i informació en un format llegible computacionalment i interoperable semànticament. Tenint en compte que el potencial de l'estandardització es fonamenta en la seva adopció generalitzada, la infraestructura central de la informació es construirà basant-se en els principis de Codi Obert, Accés Obert i Dades Oberts (de l'anglès Open Source, Open Access i Open Data).

Segons Gerhard Ecker, coordinador acadèmic del projecte "El consorci Open PHACTS reuneix un nombre d'experts sense precedents, compromesos amb la construcció d'una infraestructura de dades sostenible que doni suport a la recerca en descobriment de fàrmacs".

Bryn Williams-Jones, coordinador del projecte, afegeix "La possibilitat d'accedir a tots els recursos disponibles des d'un únic sistema constituirà un enorme benefici immediat per a les empreses farmacèutiques. Construir una infraestructura en la qual circularan les dades del futur reduirà encara més les barreres de la gestió de la informació ".

L'esforç de desenvolupament inicial es centra en un prototip que es construirà en sis mesos, utilitzant recursos i tecnologies seleccionades per a proporcionar una prova de concepte. La identificació i priorització de preguntes model en la investigació d'aquest sector serà una de les primeres activitats del projecte, que serà dirigida per les empreses farmacèutiques per proporcionar respostes reals i rellevants en descobriment de fàrmacs. L'experiència obtinguda definirà el subsegüent desenvolupament orientat a enllaçar dades procedents de diversos recursos públics amb fonts procedents dels membres del consorci. Un part important del projecte estarà orientada a involucrar a proveïdors de dades, desenvolupadors de programari, editors i creadors de base de dades comercials en una comunitat compromesa. Aquesta, juntament amb un pla de sostenibilitat proporcionarà el suport necessari per continuar l'existència de l'Espai Farmacològic Obert més enllà del període de vigència del projecte.

Sobre el IMI

La Iniciativa Europea a Medicaments Innovadors (IMI) és una associació pública / privada única entre la indústria farmacèutica, representada per la Federació Europea d'Indústries i Associacions Farmacèutiques (EFPIA, per les sigles en anglès) i la Unió Europea, representada per la Comissió Europea . El pressupost total del projecte és de 16,4 milions d'euros i tindrà una durada de tres anys. Els socis de la EFPIA aportaran dades, experiència i eines al projecte, mentre que els socis acadèmics aportaran els seus coneixements en desenvolupament, la seva experiència i habilitats, adquirides en la investigació farmacèutica acadèmica, el món editorial, la gestió de dades i la web semàntica.

Per a més informació, posar-se en contacte amb:

  • Bryn Williams-Jones (coordinador del projecte).Correu electrònic: bryn.I.williams-jones @ pfizer.com
  • Niklas Blomberg (coordinador industrial adjunt).Correu electrònic: niklas.blomberg @ astrazeneca.com
  • Gerhard Ecker (coordinador acadèmic).Correu electrònic: gerhard.f.ecker @ univie.ac.at
  • Barend Mons (coordinador acadèmic adjunt). Correu electrònic: barend.mons @ nbic.nl
  • Daniela Past (directora del projecte). Correu electrònic: daniela.past @ univie.ac.at
  • Anika Roure (premsa i mitjans de comunicació). Correu electrònic: anika.robl @ univie.ac.at www.openphacts.org

Llistat de socis: 

  • Pfizer Limited 
  • Universitat de Viena 
  • Universitat Tècnica de Dinamarca 
  • Universitat d'Hamburg 
  • BioSolveIT GmbH 
  • Consorci Mar Parc de Salut de Barcelona 
  • Centre Mèdic de la Universitat de Leiden 
  • Reial Societat de Química 
  • Universitat Vrije d'Amsterdam 
  • Centre Nacional d'Investigacions Oncològiques 
  • Universitat de Manchester
  • Universitat de Maastricht 
  • Academic Concept Knowledge Ltd 
  • Universitat de Santiago de Compostela 
  • Universitat Renana Friedrich Wilhelms de Bonn 
  • AstraZeneca AB 
  • GlaxoSmithKline Research and Development Ltd 
  • Laboratoris del Dr Esteve, S.A.
  • Novartis Pharma AG 
  • Merck Serono 
  • H. Lundbeck A / S 
  • Eli Lilly and Company Ltd

Totes les notícies

Contacte

Cap de Comunicació:
Rosa Manaut

Servei de Comunicació:
Marta Calsina(ELIMINAR)

Tel:
(+34) 93 316 06 80
(+34) 699 094 833

Doctor Aiguader, 88
08003 Barcelona

© Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques Nota legal | Política de cookies | Mapa web | Accessibilitat | Adreça / Accessos | Contacte