IMIM - Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques

Farmacología de sistemas Jordi Mestres

El Grupo de farmacología de sistemas fue creado en septiembre de 2003 y forma parte del Programa de Investigación en Informática Biomédica, una de las unidades de programas de investigación del Instituto de Investigación del Hospital del Mar (IMIM). Investigamos en la interfaz entre la química y la biología, donde el foco actual es el desarrollo de herramientas y bases de datos de bioquimioinformática, el análisis topográfico de superficies moleculares y el diseño de protocolos para el cribado virtual.

Nuestro objetivo es desarrollar y aplicar herramientas informáticas para la identificación sistemática de moléculas activas para que se utilicen familias terapéuticamente relevantes ya sea, al principio, como sondas químicas de validación o bien, al final, como blancos para la generación principal dentro de los procesos de descubrimiento farmacológico.

Proyectos

  • EU-ADR ALERT: detección temprana de reacciones farmacológicas adversas mediante la extracción integrativa de registros clínicos y conocimiento biomédico. El objetivo general de este proyecto es el diseño, desarrollo y validación de un sistema informatizado que explote los datos de los registros sanitarios electrónicos y las bases de datos biomédicos para la detección temprana de reacciones farmacológicas adversas. El sistema ALERT generará señales mediante la extracción de datos y texto, técnicas epidemiológicas y otras técnicas informáticas y, en consecuencia, confirmará estas señales para arrojar luz al conocimiento actual de los mecanismos biológicos y a las capacidades de predicción in silico.  El sistema debería ser capaz de detectar señales de una forma mejor y más rápida que los sistemas de registro espontáneos y debería permitir identificar subpoblaciones con un riesgo más elevado de RFA. Leer más
  • CancerGrid: sistema informático en red para el diseño de fármacos de efecto rápido contra el cáncer. El consorcio desarrollará y perfeccionará métodos para el enriquecimiento de las bibliotecas moleculares para facilitar el descubrimiento de posibles agentes contra el cáncer. Utilizando tecnología informática en red, junto con los nuevos métodos de enriquecimiento de bibliotecas, la probabilidad de descubrir nuevas pistas contra el cáncer se verá incrementada sustancialmente; sin embargo, la tecnología resultante resultará inservible para otros objetivos biológicos. Leer más
  • Desarrollo de nuevas metodologías basadas en el conocimiento para el refinamiento de modelos de proteínas diana y su aplicación al diseño dirigido de compuestos: el modelado de estructuras proteicas por homología a menudo es la única fuente de información estructural para diseñar moléculas dirigidas a proteínas diana o familias diana farmacológicamente relevantes. Aunque los métodos para modelar estructuras proteicas han mejorado considerablemente en los últimos años, la calidad de los modelos estructurales derivados pocas veces resulta suficiente para su aplicación en el diseño de moléculas basado en estructuras. No obstante, en paralelo a los avances en determinación y modelado de estructuras proteicas, se han sintetizado y caracterizado un gran número de moléculas con los años y, recientemente, en los ensayos bioquímicos, se ha probado su afinidad de unión a las proteínas. El principal objetivo del proyecto es incorporar de forma sistemática todos los datos acumulados en el centro de química en protocolos de modelado por homología para producir modelos proteicos de mejor calidad que sean consistentes con las características estructurales de los ligandos conocidos. Leer más
  • Desarrollo de plataformas tecnológicas comunes dirigidas a la identificación de candidatos a desarrollo preclínico en varias áreas terapéuticas. Este proyecto tiene dos objetivos principales: por un lado, construir una biblioteca química con comentarios a dianas directamente asociadas con enfermedades concretas (dolor y obesidad) y, por otro lado, diseñar, implementar y aplicar nuevas estrategias quimiogenómicas basadas en el conocimiento para la identificación sistemática de nuevos blancos para determinadas dianas de especial relevancia terapéutica. Leer más
  • Desarrollo de una plataforma quimiogenómica para la identificación de fármacos en familias de proteínas: este proyecto consiste en desarrollar una plataforma quimiogenómica que, al explotar al máximo la información en las dianas y ligandos disponibles fuera de allí, produzca normas basadas en conocimiento para el cribado in silico de bibliotecas virtuales. Esto posiblemente permita la identificación de estructuras privilegiadas personalizadas para familias diana enteras de considerable interés terapéutico; por consiguiente, ofrece oportunidades no sólo para dirigir programas de descubrimiento, sino también para un tipo químico de validación de dianas de forma quimiogenómica. Leer más
  • INFOBIOMED: estructuración de informática biomédica europea para ayudar a la asistencia sanitaria individualizada. El objetivo de la red INFOBIOMED es establecer una estructura durable para el enfoque colaborativo descrito a nivel europeo, movilizando la masa crítica de recursos necesarios para permitir el enfoque colaborativo que respalda la consolidación de la informática biomédica como una disciplina científica crucial para la asistencia sanitaria futura. El objetivo de las aplicaciones piloto en ámbitos concretos radica en demostrar los beneficios de un enfoque sinergístico en la informática biomédica. Leer más
  • Perfilado farmacológico in silico de moléculas para familias de proteínas de especial relevancia para la salud humana: la quimiogenómica ha surgido recientemente como una disciplina situada entre la química y la biología que intenta explotar las similitudes fundamentales retenidas entre los miembros de una determinada proteína o entre proteínas sucesivas de una ruta dada para el diseño de bibliotecas moleculares dirigidas a las familias y/o dirigidas a las rutas. La aplicación de las estrategias quimiogenómicas a la investigación cardiovascular  busca plantear el descubrimiento farmacológico de enfermedades cardiovasculares de una forma más sistemática y basada en el conocimiento, estableciendo un continuo de información del ligando a la diana y a la ruta en esta área terapéutica, con el potencial de identificar estructuras privilegiadas presentes en las moléculas centradas en miembros proteicos de familias diana y rutas asociadas a enfermedades cardiovasculares.Leer más

Contacto

Coordinador:
Jordi Mestres

Tel:
93 316 05 26

Fax:
93 316 05 50

Doctor Aiguader, 88
08003 Barcelona

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